מחריף העימות בין שר הביטחון, אביגדור ליברמן, לבין היועץ המשפטי לממשלה, אביחי מנדלבליט. העימות פרץ בשעות הבוקר (יום ג', 23.1.18), לאחר שמשרד המשפטים הבהיר שליברמן אינו יכול להתערב בתכני השידור בגלי צה"ל.

ליברמן הנחה את גלי צה"ל שלא לראיין את יהונתן גפן, לאחר שהלה השווה את עהד תמימי - הנערה שניסתה להתגרות בחיילי צה"ל - לאנה פרנק, חנה סנש וזאן ד'ארק. דובר משרד המשפטים מסר בתגובה בשמה של לשכת היועץ, כי פקודת גלי צה"ל קובעת במפורש את עצמאות מפקד התחנה בנוגע לתכני השידור. בתגובה אמר ליברמן: "אני מונחה על-ידי חוק השכל הישר, שעומד מעל כל הנחיה ביורוקרטית. עם כל הכבוד וההערכה שאני רוחש ליועץ המשפטי לממשלה, במקרה הזה אני דוחה על הסף את עמדתו".

בעקבות זאת שלח מנדלבליט מכתב לליברמן, שהועבר לתקשורת בידי דוברות משרד המשפטים. בתחילת המכתב מזכיר מנדלבליט, כי קודמו יהודה וינשטיין אימץ את חוות דעתה של המשנה ליועץ, דינה זילבר, ולפיה הסמכות לתת הוראות ארגוניות למפקד התחנה מצויה בידי הרמטכ"ל וקצין חינוך ראשי, ולא בידי שר הביטחון. ואילו בנושא התכנים - התחנה אינה כפופה גם להיררכיה הצבאית.

מנדלבליט מוסיף: "הדין אינו מתיר לדרג הפוליטי להתערב בתכנים, שכן התערבות שכזו משמעה עיצוב והכתבה של השיח הציבורי. עצמאותם של כלי התקשורת, לרבות אלה הציבוריים, מפני התערבות פוליטית, היא אבן יסוד של המשטר הדמוקרטי והדין אינו מתיר פגיעה בה". לכן, הנחייתו של ליברמן בנוגע לגפן "פוגעת בעצמאות שהוקנתה לתחנה ובעיקרון של חופש העיתונות... וניתנה שלא בדין ובחוסר סמכות".

בתגובה לדבריו המאוחרים יותר של ליברמן, מוסיף מנדלבליט: "מיותר להזכיר, כי חוות דעתו המשפטית של היועץ המשפטי לממשלה בדבר הדין הינה המחייבת, בהיותו הפרשן המוסמך של החוק לכלל רשויות המדינה, ושרי הממשלה בכלל זה".