אתר מקראי של עמותת גשר מסייע ללימודי התנ"ך. האתר, "מקרא גשר" שמו, מיועד לתלמידי ביה"ס מכיתה ז' עד י"ב. הוא מציע גלישה ידידותית ונוחה לתלמיד בשילוב הצגת החומר התנ"כי הנלמד בביה"ס. האתר עובד בשיתוף עם משרד החינוך ובכך מתאים עצמו לדרישות הלימודיות של בתי הספר. דרכי לימוד שונות, הכוללות את כלל הפרשנים, מציגות סרגל ציר הזמן מתקופת האבות ועד לימי מלחמת העולם השנייה, אנציקלופדיית מונחים ושמות ועוד.
האתר בנוי כספרייה של ספרים ובכל מדף מצוי ספר שונה או לינקים של ניבים, מאמרים וביטויים, אנציקלופדיה וכיו"ב. באופן זה יכול התלמיד להיכנס בלחיצת כפתור לספר הלימוד הנלמד בביה"ס ולהבין את הציטוטים או פרשנויות על-פי המפרש אשר נדרש בכיתה. בנוסף האתר מציג את ציר הזמן אשר מציג את תקופת האבות ועד מלחמת העולם השנייה וצורת גרף ובכך רצף המאורעות ההיסטוריים מימי התנ"ך ועד ימינו הופך לברור ונהיר.
עמותת גשר שמה דגש על פיתוח האתר של לימודי התנ"ך, וזאת על-מנת לעודד ולטפח את לימודי התנ"ך, אשר לעיתים יכולים להיות עבור התלמידים מיגעים או בלתי מובנים, ובכך להציג את החומר הנלמד באופן ברור ופשוט אך יחד עם זאת מעניין לשלוב הרצון לדעת ולהבין יותר מכלל החומרים הנלמדים.
בשנת הלימודים הקרובה ילמדו למעלה מ70,000 תלמידים את לימודי התנ"ך בסיוע האתר. לתלמידים פותחה שית לימוד ייחודית המשתמשת באתר ככלי לימודים מרכזי.