במבצע צוק איתן, תקף (30.7.14) צה"ל בית ספר של אונרא בג'בליה ששימש כמחסה. בתקיפה נהרגו כ-20 בני אדם ונפצעו עשרות נוספים. הצבא התיר (יום ה', 19.3.15) לפרסם כי ממצאי חקירת האירוע שהועברו לפרקליט הצבאי הראשי, אלוף דני עפרוני, העלו יסוד סביר
לחשד כי התקיפה בוצעה בניגוד לכללים המחייבים את צה"ל. הפצ"ר הורה על פתיחה בחקירת מצ"ח לבירור נסיבות האירוע.

עד כה הועברו לבירור על-ידי מנגנון הבירור המטכ"לי טענות ביחס ללמעלה מ-120 אירועים. מתוכם, 65 אירועים כבר נבחנו והופנו לפרקליט הצבאי הראשי לשם קבלת החלטה. מתוך אירועים אלו, ביחס לשישה אירועים הוחלט על-ידי הפרקליט הצבאי הראשי על פתיחה בחקירה פלילית. חקירות אלה עודן מתנהלות או שהושלמו וממצאיהן הועברו לבחינת הפרקליט הצבאי הראשי. ביחס ל-17 אירועים נוספים החליט הפרקליט הצבאי הראשי על סיום הטיפול באירוע ללא פתיחה בחקירה פלילית. ביחס לחלק מאירועים אלו מצא הפצ"ר לנכון להמליץ על הפקת לקחים מבצעיים שונים. ביחס לאירועים מסוימים שהוחלט על סיום הטיפול בעניינם, נמצא כי לא זוהתה מעורבות כלשהי של כוחות צה"ל באירוע. ביחס לחלק מן האירועים שנבחנו והופנו אליו, סבר הפצ"ר כי דרוש לו מידע נוסף לשם קבלת החלטה ולכן הוחזרו אירועים אלו למנגנון לשם השלמת נתונים. עשרות אירועים נוספים עודם מצויים בשלבי בדיקה על-ידי המנגנון וממצאיהם צפויים להתקבל בהמשך.

עד כה הפרקליט הצבאי הראשי על פתיחה בחקירה פלילית ביחס ל-13 אירועים. מתוך החקירות הפליליות הללו, החליט הפרקליט הצבאי הראשי על סגירתן של שתיים ללא נקיטה בצעדים פליליים או משמעתיים כלשהם. יתר החקירות עודן מתנהלות או שהושלמו וממצאיהן הועברו לבחינת הפרקליט הצבאי הראשי.

בין היתר נמצא כי אזרחים נפגעו או נטען שנפגעו במקומות בהם לא היו אמורים להימצא, לאחר שהוזהרו, שהירי היה מידתי, שלא נפגעו מקומות שנטען כי נפגעו, כי היו נפגעים כתוצאה מתקלות טכניות שלא ניתן היה לצפות ועוד. למעשה, למעט מקרים בודדים, פעל צה"ל בהתאם להוראות ובכפוף לדיני המלחמה הבינלאומיים.