השרה לאיכות הסביבה, פרופ' יהודית נאות, הודיעה למזכיר הממשלה, כי היא מתנגדת להצעת ההחלטה להקים את הישוב הקהילתי "כפר המדע" בנגב. ההצעה אמורה לידון (יום ב', 16.2.04), בוועדת השרים לעניין הקמת ישובים חדשים.
בפנייתה למזכיר הממשלה, עו"ד יצחק מימון, מציינת השרה נאות כי בניית יישוב חדש במרחק של כ-2 ק"מ מהעיר ירוחם, לא רק שלא תתרום לישוב הקיים ותגרום להזנחה של המרכז הוותיק של ירוחם, אלא תביא ליצירת שתי אוכלוסיות מנותקות ומנוכרות זו מזו. לדעת השרה נאות, על הממשלה לנקוט בצעדים לחיזוק ישובים קיימים, הזקוקים למשיכת אוכלוסייה חזקה, ולהביא ליצירת מקומות תעסוקה.
עוד הוסיפה השרה ואמרה, כי היישוב החדש ייהנה מהשקעות ממשלתיות במקום שאלה יופנו לטובת חיזוק תושבי ירוחם. כמו-כן, לדבריה יש מקום להצמיד לירוחם, כחלק בלתי נפרד מהיישוב, שכונה שתהווה מקור משיכה לתושבים חדשים, תעלה את רמת השירותים ותוזיל את עלות התשתיות הפיזיות.
בפנייתה מדגישה השרה נאות כי היישוב המוצע נמצא בתוך השטח שהוכרז על-ידי מדינת ישראל כ"ארץ המכתשים", לפי החלטת ממשלה מספר 3497 מיום 3 ביולי 1994, ושלב א' של הפרויקט, חודר היישוב אל תוך שמורת הטבע המוכרזת. לדעת השרה נאות הקמת יישוב בשטח המוצע, בקרבה לשפת המצוק, תפגע בנכס גיאולוגי ייחודי בעולם.