המועצה לשלום הילד שולחת אצבע מאשימה כלפי משרד החינוך בטענה כי המערכת גורמת להגדלת הפערים בין התלמידים בישראל. כיממה לאחר קבלת תוצאות מבחני המיצ"ב טוענים במועצה (ד', 18.8.04), כי יותר משיש לדאוג לתוצאה הכללית הנמוכה, יש לדאוג מהפערים העצומים המתגלים במיצ"ב, בין חלשים לחזקים, בין עניים לעשירים, בין יהודים לערבים.
מנכ"ל המועצה לשלום הילד, ד"ר יצחק קדמן, טוען כי הגורם העיקרי להעמקת פערים במערכת החינוך, הוא הרעה החולה של תשלומי הורים, הגורמים לפערים עצומים, בין תלמיד לתלמיד בתוך בית הספר, ובין בתי ספר באיזורים שונים.
מנכ"ל המועצה קרא בדיון שהתקיים (יום ד',18.8.04) בוועדת החינוך של הכנסת שלא לאשר השנה את תשלומי ההורים כדי לגרום למשבר חמור, שרק הוא יוכל לגרום לרפורמה בנושא כאוב זה.