מערכת הביטחון חידשה בניית גדר הפרדה סמוך לאריאל, לאחר שנמצא פתרון להתנגדות האמריקנים ולפסיקת בג"צ. הגדר, שתוכננה במקור להיות באורך של 9 ק"מ סביב אריאל, תיבנה עתה בחלקה - רק 4 ק"מ. חלקה השני ייבנה בשלבים מאוחרים יותר.
החשש עתה הוא, כי חידוש הבניה במקום יעורר התנגדות אקטיבית מצד הפלשתינים ויביא להפרת הפסקת האש היחסית שהושגה.
כזכור כבר בתחילת שנת 2004 הסכימה ישראל לבנות גדרות נפרדות וקצרות יותר סביב אריאל וההתנחלויות הסמוכות לה, אך לא לחבר גדרות אלו לגדר המרכזית.
בכירים בממשל האמריקני לא הסתפקו בכך, והביעו לא אחת תרעומת על כוונת ישראל לבנות את הגדר סביב אריאל ובכך לקבע עובדות בשטח. ריצ'רד באוצ'ר, אף הגדיר את הגדר כבעייה "משום שהיא קובעת את הגבולות הסופיים, היא מפקיעה רכוש פלשתיני ומקשה עוד על חייהם של הפלשתינים".
בוושינגטון הביעו חשש בזמנו, כי בניית גדר ההפרדה באזור אריאל מהווה תמורה ל"גורמים מסוימים בממשלת ישראל שתמכו בהצבעה על אישור תוכנית ההינתקות". הכוונה הייתה כפי הנראה לקבל תמיכתו של בנימין נתניהו, שהתנה אותה בהשלמת בניית הגדר סביב אריאל כמו גם סביב איזורים בעייתיים אחרים.
