האשמות רבות הופנו נגד קטר במשבר הדיפלומטי הנוכחי שלה מול מדינות ערב המתונות, כשהמרכזית שבהן היא הקשר בין קטר למגוון גורמי טרור כולל הטליבאן, האחים המוסלמים ואירן. אולם, היחסים המטרידים ביותר של קטר היו מול אל-קאעידה - אומר Washington Institute, העוסק במדיניות ארה"ב במזרח התיכון.
שלוחת אל-קאעידה בסוריה נהנית מלגיטימיות מצד קטר, כארגון הנלחם נגד משטר אסד וגם נגד דאעש. רבים מהתורמים הגדולים לארגון רואים בו "קיצונים מתונים" בסכסוך המתמשך הזה. אל-קאעידה בסוריה נתפשת כקלילה יותר, אם זה בגלל אנשים שמסכימים עם האידיאולוגיה אותה הם רואים כמתונה יותר מהחלופות, או שהם מוכנים להתעלם מהאידיאולוגיה ולתמוך בארגון שבאמת יכול להפיל את משטר אסד. בראייה זו, תרומתם לארגון לא מהווה מימון מפורש לאל-קאעידה אלא לסיום הלחימה.
יש צורך במאבק אגרסיבי נגד תפיסה שגויה זו, סבור מכון המחקר. כוחו של אל-קאעידה בסוריה מעניק כעת לארגון הזדמנויות חדשות, מבחינה מבצעית וכספית, דבר המשאיר אותו כאיום על המערב. לפי דוח של מועצת הביטחון מיוני 2016, אל-קאעידה בסוריה נותר אחד מענפי הארגון היעילים ביותר בעולם. לכן, סגירת מקורות ההכנסה והמשאבים של הארגון היא בעלת חשיבות מכרעת.
לתורמים ומגיסי תרומות מהמפרץ הפרסי, יש היסטוריה ארוכה של תמיכה באל-קאעידה ובשלוחותיו. רוב שלוחות אל-קאעידה לא מסתמכות על תורמים פרטיים, אך אל-קאעידה בסוריה לא פועל כך. לפי מועצת הביטחון של האו"ם, נכון לינואר 2017 השלוחה בסוריה ממשיכה לקבל את עיקר הכנסותיה מתורמים מחו"ל, בנוסף למקורות הכנסה פליליים כמו תשלומי כופר, סחיטה ושלל מלחמה.
ההערכה היא, שתקציב השלוחה הוא 10 מיליון דולר בשנה, כשכמה מיליוני דולרים מגיעים מתורמים מהמפרץ. כך למשל, חג'אג' אל-עג'מי, אזרח כוויית שהוטלו עליו סנקציות בשנת 2014, ביקש דרך הטוויטר תרומות עבור אל-קאעידה. האזרח הקטרי סעד בן אל-קאעדי פרסם בפייסבוק ובוואטסאפ בקשות לתרומות עבור המורדים בסוריה, ביניהם לוחמי אל-קאעידה. מסיבה זו אמר בשנת 2014
דוד כהן ממשרד האוצר האמריקני, כי קטר היא בעלת שיפוט מתירני בכל הקשור למימון טרור. הבעיה היא לא רק מימון קטר את חמאס, אמר בזמנו כהן, אלא במימון הקטרי של ארגוני טרור בסוריה.
כהן אמר שמצב זה יכול להחמיר, וכך אכן קרה. לפי דיווח של פייננשל טיימס, קטר שילמה כופר של כמה מאות מיליוני דולרים, תמורת בני המשפחת המלוכה שנחטפו בעירק. חלק מהכסף שולם גם לקבוצות הקשורות לאל-קאעידה. גם אם הגזימו בתיאור הסכום, עדיין מדובר בכסף קטרי שהועבר לאל-קאעידה.
קטר נקטה בפעולות נגד מממני טרור בודדים, כמו הקפאת נכסיהם, הטלת איסורי נסיעה, סגירת חשבונות וסגירת ארגוני צדקה הקשורים לאל-קאעידה. במקרים אלו, הדבר נעשה רק לאחר לחץ מצד ארה"ב, וקטר נרתעה מפרסום מהלכים אלו. בינתיים, לפעולותיה של קטר היו תוצאות מעורבות. לפי דוח של מחלקת המדינה האמריקנית בשנת 2014, קטר סגרה את פלטפורמות גיוס הכספים של אל-קאעדי. אולם, שנה לאחר מכן נאמר שהוא עדיין ממשיך לגייס כספים עבור אל-קאעידה. מקרה אחר הוא זה של עמר אל-קטרי, ירדני המתגורר בקטר, שסיפק "תמיכה רחבה" לאל-קאעידה בסוריה, לפי דיווח של משרד האוצר האמריקני. בשנת 2014 פורסם, כי קטר גירשה ירדני המתגורר בקטר שעסק בתמיכה לטרור, אך לא נאמר האם מדובר באל-קטרי.
לפי דוח משנת 2015 של מחלקת המדינה האמריקנית, קטר אומנם העמידה לדין מממני טרור, אך עשתה זאת בקול ענות חלושה. חמישה אישים הקשורים למימון טרור נעצרו, שניים זוכו ושלושה הורשעו. אותם שלושה הורשעו בהעדרם או נידונו לתקופות מאסר קלות. לפי דוח של האו"ם, אחד מהם אף חזר לעסוק במימון טרור לאחר שחרורו.
לפני שבועיים קבעו סעודיה, איחוד האמירויות, מצרים ובחריין, כי 59 אישים ו-12 מוסדות מממנים ארגוני טרור ומקבלים סיוע מקטר. רבים מביניהם, הוגדרו בעבר על-ידי ארה"ב ובריטניה כקשורים למימון אל-קאעידה, למרות שהרשימה כוללת גם כאלו המממנים ארגוני טרור אחרים.
רשימה זו דווקא יכולה לעזור לקטר, כאשר היא נותנת לה הזדמנות לסייע בפתרון המשבר עם שכנותיה ודרך לעשות זאת, אומר Washington Institute: היא יכולה לפעול נגד אלו המופיעים ברשימה, שהוגדרו כקשורים לטרור על-ידי המערב. באופן פרטני, קטר יכולה לפעול נגד מממני אל-קאעידה המופיעים ברשימה ולפעול נגד מימון טרור, כפי שהתחייבה בסעודיה לפני חודש. קטר איחרה בתקיפת מימון ארגוני טרור, במיוחד אל-קאעידה בסוריה. אבל עדיף מאוחר מאשר לעולם לא.