גוברת המתיחות בין הפת"ח לחמאס. המגעים להקמת ממשלת אחדות לאומית נקלעו למבוי סתום, בעקבות סירובה התקיף תנועת החמאס להסכים לנוסח, ולו מעורפל, ממנו תשתמע לכאורה הכרה בזכות קיומה של מדינת ישראל. יו"ר הרשות הפלשתינית, אבו מאזן, אמר (יום שבת) לאחר פגישתו במצרים עם הנשיא חוסני מובארק, כי המאמצים להקמת ממשלת אחדות לאומית עם החמאס חזרו לנקודת האפס. לדבריו, החמאס אינו מסכים להיענות לדרישות בסיסיות ולכן תנועת הפת"ח לא תצטרף לממשלת אחדות.

שר החוץ בממשלת החמאס, מחמוד א-זהאר, הבהיר יום קודם (22.9.06) במסיבת עיתונאים שקיים בעזה, כי החמאס לא תיטול חלק בממשלה פלשתינית שתכיר בישראל, בטענה שכל הממשלות הקודמות מאז הסכמי אוסלו ב- 1993 לא השיגו דבר מההכרה בישראל.

א-זהאר מאשים את ארגון הפת"ח בניסיון להפיל את הממשלה באמצעות בחינת האפשרות שאבו מאזן יכריז על בחירות חדשות לנשיאות ולפרלמנט או על-ידי פיטורי השרים והקמת ממשלת חירום. א-זהאר הזהיר, כי צעדים מעין אלה - משמעותם פתיחת השער בפני מלחמת אזרחים ברשות הפלשתינית. לדברים אלה נוסף גם איום פומבי של גדודי עז-אדין אל-קסאם, הזרוע הצבאית של החמאס, להגיב בכוח על דפוס ההתנהגות של הפת"ח ולפרסם את תיקי השחיתות של בכירי הפת"ח מן העת בה כיהנו בתפקידים ממלכתיים.

בהקשר אחר, מימש א-זהאר את כוונתו, עליה הצהיר לא מכבר: לפעול לביטול הסכם המעברים שנחתם עם ישראל ושעל בסיסו הופעל מעבר רפיח. ועדה משפטית שהוקמה מטעמו קבעה כצפוי, כי ישראל הפרה מהותית את הסכם המעברים, והפרה זו מעניקה לפלשתינים, לטענת א-זהאר, זכות לתבוע מישראל פיצויים על הנזק הכלכלי שנגרם להם ולהגיע להסכם בילטראלי עם מצרים על הפעלת מעבר רפיח ללא צורך בהרשאה או בתיאום עם ישראל.

א-זהאר התנגד ליצור כל זיקה בין סוגיית המעברים לשחרורו של החייל הישראלי החטוף, רב"ט גלעד שליט. בראיון לעיתון הלבנוני אל-מוסתקבל, הוא חזר על התנאים הפלשתינים לשחרור שליט, הכוללים: שחרור האסירים, הנערים ואסירים שריצו יותר מ- 15 שנה בכלא. הוא ציין, כי אין לחמאס אמון בישראל, ולפיכך תובעת התנועה ששחרור האסירים יתבצע במקביל להחזרתו של שליט ולא בשלב מאוחר יותר.