את עיקר המימון לפרויקט העמיד כאמור בנק ההשקעות האירופי הגדול EIB, שזהו פרויקט התשתית הגדול הראשון הממומן על ידו בישראל. EIB הינו בנק בבעלות מספר מדינות האיחוד האירופי המתמחה במימון פרויקטי תשתית בתחומי האנרגיה ואיכות הסביבה. במשרד החשב הכללי מקווים כי ההצלחה של הבאת בנק ההשקעות האירופי תנוצל בהמשך למימון פרויקטים נוספים בישראל.
באוצר אומרים כי כניסתם של הבנקים הזרים למימון פרויקטי התשתית בישראל חשובה ביותר למשק הישראלי ומהווה תחרות לבנקים המקומיים ששלטו עד כה במימון הפרויקטים בישראל.
המתקן נבנה בשיטת ה-BOT, לפיה הזכיין מקים ומפעיל את המתקן במשך תקופה של 25 שנה. בסיום תקופת הזיכיון מוחזר המתקן לרשות המדינה. היקף ההשקעה הכולל בפרויקט נאמד בכ-1.8 מיליארד ש"ח. המתקן יוקם על-ידי חברת H2ID המורכבת מחברת הנדסת התפלה ומחברת שיכון ובינוי. המחיר לקו"ב מים הינו מהנמוכים בעולם ויעמוד על 2.6 שקלים לקו"ב מים, לעומת למעלה מ-3 שקלים ביתר מתקני ההתפלה.
בעקבות החלטת הממשלה להרחיב את היקף ההתפלה ל-600 מיליון קו"ב בשנה, מתוך יעד כולל של 750 מיליון קו"ב עד ל-2020, מובילה היום ועדת המכרזים הבינמשרדית בראשות הסגן הבכיר לחשב הכללי, גיל שבתאי, ובהשתתפות אגף התקציבים, רשות המים ומשרד התשתיות מכרז BOT להקמת מתקן התפלה חדש גם בשורק, בהיקף של 150 מיליון קו"ב. במקביל, מנהלת הוועדה את ההתקשרות להקמתו של מתקן ההתפלה באשדוד בהיקף של 100 מיליון קו"ב בשנה, בידי חברת מקורות ייזום ופיתוח.
