מנכ"ל הרשות השנייה, מוטי שקלאר, פנה בטרם קיום המשאל בליכוד, אל העורכים הראשיים של חברות החדשות בבקשה לשמור על איזון בסיקור החדשותי. לאחר המשאל, ולאור פנייתו של ח"כ אורי אריאל בדבר התנהגות התקשורת במשאל הליכוד, טען שקלאר כי "בפועל הצדיקו חברות החדשות את המוניטין העיתונאי שרכשו וסיפקו לציבור פיקוח מאוזן, תוך מתן במה הוגנת למתנגדי התוכנית".
שקלאר פנה בכתב ליועצת שר התקשורת, בעקבות פנייתו של ח"כ אריאל, כאמור, וטען כי "ככל שהדברים אמורים בחברות החדשות עליהן מפקחת הרשות השניה, בערוץ 2 ובערוץ 10, הרי שלדעתי אין בסיס לביקורת המובעת על-ידי ח"כ אריאל".
בדוגמאות שנתן, ציין שקלאר למשל כי "בחדשות ערוץ 10 שודר עימות של 45 דקות בין השר אהוד אולמרט לבין מר בני בגין. לשניהם הוקצב זמן זהה והעימות התנהל באופן מקצועי, מכובד ושודר בלב זמן צפיית השיא של הערוץ. בתוכנית האולפן המרכזי ביום שישי שודרו כתבות מקיפות על המתיישבים בהן ניתנה במה מכובדת לטענותיהם. כל זאת, מעבר לסיקור השוטף הניתן בחדשות 10 למתיישבים ביהודה ושומרון ובגוש קטיף ולמשמעות האישית והלאומית של עקירת ישובים.
בדומה, בחדשות ערוץ 2 שודרו אייטמים לא מעטים אשר עסקו בהתנגדות לתוכנית. כדי לסבר את האוזן הנה מספר דוגמאות: במהדורה המרכזית ביום 27.4 שודרו שני אייטמים בנושא ההפגנה נגד תוכנית ההינתקות; ביום 28.4 שודר אייטם בנושא מערך ההסברה של מתנגדי התוכנית;
ביום 29.4 שודרו מספר אייטמים (הן במהדורת החדשות המרכזית והן בתכנית שש עם עודד בן עמי) בנושא ההתנגדות לתוכנית, כולל הצגת סקר המראה על רוב למתנגדים; ביום 2.5 שודר סיקור של המשך מסע ההסברה נגד תכנית ההינתקות, כולל ליווי של מסע ההסברה על-ידי הכתב אילן לייזרוביץ.
"אין להתעלם מכך שבאופן טבעי", אמר שקלאר, "מקבלי ההחלטות ובעיקר רה"מ, קובעים את סדר היום הציבורי והחלטותיהם מקבלות חשיפה תקשורתית. עם זאת, אני סבור שבמכלול ניתן סיקור עיתונאי הוגן למתנגדי התוכנית כמו גם לתומכיה".
