עמותת אומ"ץ, בראשה עומד העיתונאי אריה אבנרי, הגישה עתירה לבית המשפט העליון (בג"צ 4983/05), בבקשה לחייב את הרב הראשי לישראל (האשכנזי), יונה מצגר, להשעות עצמו מתפקידו בבית הדין הרבני, ואם לא יעשה כן - להורות על השעייתו מתפקידו. אומ"ץ מיוצגת בהליך זה על-ידי עו"ד בעז ארד.

העתירה הוגשה בעקבות המלצת המשטרה להגיש כתב אישום נגד הרב מצגר, בגין טובות הנאה שקיבל לכאורה באופן בלתי חוקי. המשיבים בעתירה הינם הרב מצגר; נשיא בית הדין הרבני, הרב הראשי לישראל (הספרדי) שלמה עמאר; ושרת המשפטים, ציפי לבני.

בעתירה מבקשת העמותה, להורות לרב מצגר להימנע מלישב בדיונים משפטיים בבית הדין הרבני הגדול; וכן להימנע מלהשתתף בוועדה למינוי דיינים שזימנה שרת המשפטים, ציפי לבני. הרב עמאר נדרש בעתירה - מכוח תפקידו כנשיא בית הדין הרבני הגדול - לאסור על הרב מצגר מלישב בדין כדיין, וזאת לפחות עד ההכרעה בעניינו.

העותרת מנמקת את דרישותיה וקובעת, כי "בנסיבות שנוצרו, עם השלמת החקירה הפלילית, אין זה סביר כי המשיב 1 יוסיף ויכהן כדיין בבית הדין הרבני הגדול. המשך כהונתו במשרה רמה זו, פוגעת פגיעה קשה במעמדו של בית הדין הרבני הגדול בפרט, ובמעמדה הציבורי של הרשות השופטת בכלל. מהטעם הנ"ל אף אין זה סביר כי המשיב 1 יוסיף ויכהן כחבר הוועדה".

הרב מצגר הודיע בימים האחרונים פומבית, כי אין בכוונתו להשעות עצמו מתפקידו. הרב מסר, כי הוא שמח על כך שהמשטרה סיימה סוף-סוף את החקירה, וכי הוא ימתין להחלטת היועץ המשפטי לממשלה בטרם יחליט כיצד לנהוג.

היועמ"ש, מני מזוז, התייחס אף הוא בימים האחרונים לסוגיה זו, ואמר כי מבחינה משפטית אין מקום לחייב את מצגר להשעות עצמו, אך מבחינה ציבורית מן הראוי שהרב יפסיק זמנית את תפקידו.