עיסקת טיעון הושגה בין ח"כ יאיר פרץ לבין הפרקליטות. על-פי עיסקת הטיעון, הודה פרץ בהשגת תואר אקדמי, שלא כדין, ממכללת ברלינגטון. בתמורה מסכימה התביעה למחוק סעיף אישום שעניינם ניסיון במירמה תואר אקדמי מאוניברסיטת בר-אילן, וכן עבירה של הפרת אמונים.
עיסקת הטיעון הוצגה (יום ה', 17.11.05) בבית המשפט השלום בתל אביב, שם מתנהל משפטו של ח"כ פרץ.
בכתב האישום המקורי נטען, כי פרץ ביצע את העבירות בתקופה ששימש עוזר שר העבודה והרווחה. נטען, כי פרץ פעל לקבל במרמה תואר אקדמאי ואף פרסם זאת באתר האינטרנט של הכנסת.
המדינה טוענת, באמצעות עוה"ד בילנקה ורמתי מפרקליטות מחוז תל אביב, כי בחודש ספטמבר 1997 פנה פרץ במטרה להשיג תעודת תואר ראשון מאוניברסיטה, מבלי לעמוד בדרישות האקדמיות שלה. לפי החשד, בפגישה בין איש הקשר לנאשם קשרו השניים להשיג תעודת תואר ראשון כוזב מאוניברסיטת בר-אילן, וזאת למרות שהנאשם לא עמד בדרישות האקדמיות של אוניברסיטת בר-אילן לתואר ראשון ואף לא נרשם אליה בכלל.
בהמשך, במהלך החודשים ספטמבר-דצמבר 1997 האיץ הנאשם באיש הקשר, להשיג עבורו את התעודה הכוזבת. במהלך שיחותיהם סוכם בינהם כי עם העברת התעודה לנאשם יקבל מהנאשם סך של 10,000 ש"ח, וכמקדמה העביר לו סך של כ-1500 ש"ח. בסופו של דבר, מסיבות שאינן קשורות לנאשם, לא העביר איש הקשר לנאשם את תעודת התואר הכוזבת.
לאחר דברים אלה, פנה הנאשם ונרשם ללימודי תואר ראשון בפסיכולוגיה בשלוחת ברלינגטון בתאריך 3.2.98 וקיבל אישור זכאות לתואר בתאריך 4.5.98. עלות הלימודים לתואר ראשון בפסיכולוגיה בשלוחת ברלינגטון באותה תקופה עמדה על כ-25,000 ש"ח.
בכתב האישום נטען, כי במצב זה, אפשרו לו שותפיו ללמוד בשלוחת ברלינגטון מבלי שנדרש לשלם את שכר הלימוד וזאת מפאת מעמדו ותפקידו הציבורי. לפי כתב האישום, ח"כ פרץ נתן תמורה: הוא המליץ על שלוחת ברלינגטון בפני פעילים שונים של ש"ס בלשכתו אשר במשרד העבודה, ובכך קידם את ענייניו הפרטיים של מי ששימש באותה תקופה מנכ"ל חברת "מודום" אשר, בין השאר, הפעילה בארץ את שלוחת ברלינגטון.
בכתב האישום נאמר כי במועד כלשהו, בסמוך לאחר רישומו של הנאשם ללימודים בשלוחת ברלינגטון, הוא פנה אל הבכיר וביקש לעיין בדוגמאות של חובות אקדמיות המוגשות לשלוחה. הבכיר היפנה אותו לספריה של "מודום" בתל אביב והדריך את מנהל הספריה לאפשר לנאשם לקחת מן הספרייה עבודות לעיונו.
לפי כתב האישום, מייד לאחר מכן הגיע פרץ יחד עם עוזריו לספריה, נטל (באמצעות עוזריו) את עבודת הגמר של תלמידה בשלוחה ואת העבודות הקטנות של תלמיד אחר אשר הושארו בספריה כדי שישמשו דוגמא לעבודות מצטיינות, והגיש את העבודות, לאחר שהחליף את עמוד השער לעמוד הנושא את פרטיו האישיים, לבדיקת המרצה בשלוחת ברלינגטון, בהציגו מצג כאילו העבודות הוכנו על ידו.
על-סמך המצג השקרי הזה קיבל הנאשם מברלינגטון קולג' זכאות לתואר ראשון בפסיכולוגיה. לאחר מכן העביר הנאשם את התעודה למשרד החינוך וקיבל במירמה הכרה רישמית בתואר, ולבסוף, על-פי כתב האישום, כתב הנאשם במירמה באתר האינטרנט הרשמי של הכנסת כי הוא בעל תואר ראשון.
כאמור, במסגרת עיסקת הטיעון הוסכם על מחיקת חלק מהעבירות שיוחסו לו. היועץ המשפטי לממשלה, מני מזוז, דחה את פניותיו של פרץ שביקש שהפרקליטות תימנע מדרישה להטיל עליו עונש חמור.