טלטלה באגף המודיעין של צה"ל. אלוף משנה א' המפקד על יחידה 504, היחידה הסודית להפעלת סוכנים, הודיע (יום ה', 19.4.12) על פרישתו מן התפקיד בקיץ. זאת לאחר שקידומו לדרגת תת-אלוף עוכב בשל הקשר שלו לפרשת הרפז והמסמך המפוברק.

העיכוב בקידום בוצע בהתאם להנחיית הרמטכ"ל, רב אלוף בני גנץ, שעל פיה איש מן המעורבים בפרשת הרפז לא מקודם ולא מודח מתפקידו כל עוד לא הוגש דוח מבקר המדינה בנושא.

שמו של א' נקשר אל הפרשה כמי שהיה בקשרים קרובים עם בועז הרפז ואף מצוין כאחד הגורמים שעליהם נמתחת ביקורת בדוח שיפרסם בקרוב מבקר המדינה, השופט (בדימ.) מיכה לינדנשטראוס.

גורמים צבאיים העריכו כי הדוח יפורסם בשלב מוקדם יותר ועל כן מינוי לא' ממלא-מקום. אותו ממלא-מקום כבר נכנס לתפקידו.

הודעתו של אל"מ א' הפתיעה רבים במערך המודיעין של צה"ל וקצינים רבים ביקשו ממנו להישאר בתפקידו. אולם לדבריו, הוא אינו חוזר בו מהחלטתו לפרוש בקיץ.

בעקבות הודעתו של א' על פרישתו צפוי אלוף כוכבי למנות לראש יחידה 504, אשר מפעילה סוכנים חשאיים במדינות ערב שהמפורסם שבהם הוא המרגל אלי כהן שנתפס בסוריה, את אלוף משנה מ'. מ' אמור היה להתמנות לקצין המודיעין של פיקוד הדרום ועד עתה היה בעל הסיכויים הנמוכים לפיקוד על היחידה.

דוח מבקר המדינה שיפורסם בפרשת הרפז והמסמך המפוברק צפוי למתוח ביקורת על קצינים נוספים מחיל המודיעין ובהם מפקד יחידת 8200 ומפקד סיירת מטכ"ל.

הקצינים הבכירים הללו ניהלו קשרים הדוקים עם הרפז בניגוד לפקודות הצבא ושיתפו אותו במידע רגיש ביותר למרות שסיווגו הביטחוני הורד עם שחרורו מצה"ל.