המדינה לא תפצה את עו"ד רפאל שטוב על כך שבמשך שבע שנים נמנע ממנו להופיע בפני בתי דין רבניים ב-21 של תיקים. כך קבעה (27.8.13) שופטת בית משפט השלום בתל אביב,
אביגיל כהן, למרות ביקורתה על התנהלות בתי הדין בנושא זה.
בשנת 1999 ייצג שטוב לקוחות בפני הרכב בית הדין הרבני האיזורי לענייני הקדשות, בראשותו של הרב צבי שיינפלד. הוא נקט כלפי הדיין בלשון שכינה בית הדין הרבני הגדול "שפת שוק" ו"כינויי גנאי וזלזול", בהם מעולם לא נתקלו הדיינים לדבריהם. ביה"ד הגדול הורה להעביר את הנושא לטיפולה של לשכת עורכי הדין ודרש משטוב להתנצל בפני הרב שיינפלד, אך הוא סירב. בשל כל הורה בית הדין האיזורי להפסיק את ייצוגו של שטוב באותו נושא.
בעקבות זאת פסלו הרכבי בית הדין, בעיקר בראשות הרב שיינפלד אך גם בהרכבים אחרים, את שטוב מלהופיע בפניהם. בית הדין הרבני מוסמך לעשות זאת, שלא כמו בבית משפט רגיל בו על השופט לפסול את עצמו אם נוצרה יריבות אישית בינו לבין אחד מעורכי הדין. הפסילות הסתמכו ברובן על החלטת בית הדין הגדול, אשר כאמור דרש משטוב להתנצל בפני הרב שיינפלד. כך נוצר מצב, בו לא יכול היה שטוב לייצג את לקוחותיו בענייני הקדשות (משום שרק הרכב הרב שיינפלד דן בנושא) ובענייני ממונות בבית הדין הרבני בירושלים. רק בסוף שנת 2005 קבע הרב הראשי דאז, הרב
שלמה עמאר, מתווה שפתר את הבעיה.
שטוב תבע שהדיינים והמדינה יפצו אותו. כהן דחתה כבר בתחילת הדיון את התביעה נגד הדיינים, בשל החסינות המוחלטת המוקנית להם (כמו לשופטים) מפני תביעות נזיקין. כעת דחתה גם את התביעה נגד המדינה, באומרה שאין מקום לעקוף את חסינות הדיינים על-ידי הגשת תביעה נגד המדינה. כהן מסתמכת על פסקי דין קודמים, בהם נקבע שניתן לתבוע את המדינה רק אם שופט פעל בזדון או בחוסר סמכות מודעת, וקובעת שלא זה המקרה כאן.
לצד זאת, מותחת כהן ביקורת על שני היבטים בהתנהלות בתי הדין. האחד: השימוש הנרחב בתקנה לפסילת עורך דין, אשר נעשה בלא כל קשר לתיק הספציפי אלא רק בשל היריבות בין שטוב לבין הרב שיינפלד. השני: העובדה שלא נמצא פתרון מערכתי אלא רק כעבור שש שנים.
במקביל, מותחת כהן ביקורת נוקבת גם על התנהגותו של שטוב ואומרת שהוא לא בחל במילים שאינן ראויות, בהטחת האשמות קשות ביותר ובהגשת תלונות לכל גורם אפשרי. כהן מדגישה, כי אם שופט סבור שעורך דין חרג בצורה בוטה מכללי ההתנהגות החלים עליו, ברור שאל לו להתעלם מהתנהגות זו ויש לדאוג למיצוי הדין נגדו.
בשל התנהלות בתי הדין בפרשה, לא פסקה כהן הוצאות לטובת המדינה. שטוב יוצג בידי עוה"ד צבי כהנא ורחל בר, והמדינה - בידי עו"ד שושי נרי.