במכתב שקיבלו ראשי תנועת "נשים בירוק" מפרקליטות המדינה, עולה חשש כי הפרקליטות תצדיק בעתיד שימוש בירי חי, על מי שיסרב לפנות את ביתו ביש"ע.
תשובת הפרקליטות הגיעה (28.1.04) בעקבות תלונה נדיה מטר, יו"ר התנועה, על דברי עמי איילון, לשעבר ראש השב"כ, המצוטטים ב"ידיעות אחרונות" (14.11.03). איילון התייחס לתקדים "אלטלנה", בתיאור הטיפול שיש לדעתו "להעניק" למתנחלים שלא ירצו בעתיד להתפנות מבתיהם. בתלונתה אומרת מטר, כי מדובר ב"הסתה לרצח".
איילון אמר אז לעיתון: "אגיד את זה במילים ברורות: בחיי כל מדינה או אומה יש יותר מאלטלנה אחת. מנהיגות מדינית במדינת ישראל קיבלה כבר החלטות קשות כשהיה ברור מה האלטרנטיבה, ומנהיגות מדינית בעתיד תצטרך לקבל החלטות קשות כשברור מה האלטרנטיבה".
בתשובתה של מנהלת המחלקה לתפקידים מיוחדים בפרקליטות המדינה, עו"ד טליה ששון, נאמר: "לאחר בחינת הדברים הוחלט כי אין הדברים שאמר עמי איילון במסגרת הראיון נשוא התלונה עולים כדי עבירה פלילית. להבנתנו, מר עמי איילון לא קרא לבצע מעשה אלימות במתנחלים, אלא העריך שכאשר יהיה צורך לפנות התנחלויות יהיה אחוז מסויים של התושבים שלא יסכים להתפנות מההתנחלויות באופן חופשי. במצב דברים זה, לדבריו, לא יהיה למדינה מנוס מלהתעמת עם מי שלא יציית להוראה חוקית של הממשלה הנבחרת. כאמור, לא מצאתי עבירה בדברים".
בתגובה לתשובת הפרקליטות, מביע עורך הדין אליקים העצני את חששו, שדברי ששון יתפרשו כהצדקה למלחמת אחים: "באלטלנה ירו באנשים ששחו בים, במצב שהם לא היוו סכנה לאף אחד. מה שאומרת ששון הוא שמי שיפר את החוק צפוי שיעשו לו מה שעשו לאנשי אלטלנה. היא בעצם מזמינה מלחמת אחים ומעודדת חיילים ושוטרים ואנשי ביטחון לירות במי שמסרב להתפנות". עוד אומר העצני, כי הוא רואה בדבריה "צעד נוסף לעבר התהום ואנו כבר קרובים מאוד לשפה שלו".
מטר אומרת בתגובה כי דווקא היום, כשהפרקליטות דחתה את בקשת צה"ל לאפשר פתיחה באש על מיידי אבנים ערבים ביהודה ושומרון, שוב הוכח כי הפרקליטות נוהגת ביד רכה כלפי האלימות הערבית לעומת ידה הקשה כלפי מתיישבים יהודים: "שוב הוכח שהפרקליטות מפלה בין דם לדם. אנו אזרחים נאמנים שומרי חוק הפועלים בצורה דמוקרטית".
"כלפי האויב הערבי שפועל באלימות לאור היום הפרקליטות נוהגת ברחמנות ובכפפות משי, ואילו כלפינו, תושבים יש"ע היהודים, קורבנות האלימות, היא נוטלת את הזכות הבסיסית לחיות בבתינו ללא איום של נשק חם. ביום שמציינים באירופה את המאבק נגד האנטישמיות, ישנם גורמים ממשלתיים במדינת ישראל שמשתמע מהם כי יהיה מותר לירות ביהודים כדי להוציאם מבתיהם. אנו לא רק אזרחים סוג ב', אנו מופלים לרעה גם מול אויבינו הנוהגים באלימות רצחנית כלפינו", דברי מטר.