יום לאחר ההודעה על שחרור 84 גופות מחבלים, הורה (יום ג', 5.7.11) שר הביטחון,
אהוד ברק, שלא להעביר לידי הרשות הפלשתינית חלק מהגופות.
מדובר בגופותיהם של מחבלי חמאס שביצעו פיגועים חמורים נגד אזרחי ישראל: האחים עמאד ועאדל עוודאלה, מבכירי הזרוע הצבאית של חמאס, פואד אלקואסמה, מבכירי החמאס בחברון, עבדאללה אלקואסמי, מבכירי חמאס, רמאז אסלים, שביצע את הפיגוע ב"קפה הלל" בירושלים, איהאב אבו-סלים, שביצע את פיגוע ההתאבדות בצריפין, עבד אל-רחים אלתלאחמה, מראשי הג'יהאד האיסלמי בחברון והאחראי לפיגוע בציר המתפללים בחברון.
כמו כן, לא תידון העברת גופותיהם של הנאדי ג'רדאת, המתאבדת ממסעדת "מקסים" בחיפה, עמאר עלי עבדאללה, מבצע פיגוע ההתאבדות בשוק הכרמל, ועבדאללה עבדאללה, מבצע הפיגוע במועדון ה"סטייג'" בתל-אביב.
בנוסף, הורה שר הביטחון ברק שלא להכליל בשיחות על רשימת הגופות את מי שהיו תושבי רצועת עזה.
"עיכבתי את השיח הזה על העברת הגופות, כדי לבדוק שאנחנו לא מעבירים גופות שלא נכון להעביר אותן, הן משיקולים שקשורים לשליט והן מדברים שקשורים אולי לשיקולים אחרים", אמר היום ברק במהלך ביקור בתרגיל של צה"ל. "אנחנו בוחנים את כל העניין ונראה בדיוק איך התגלגלה ההחלטה".
ברק הוסיף כי הוא מציע לא להתייחס לכל העניין בדרמת יתר: "יש שיחות עם הפלשתינים על הרבה דברים. בין היתר, עלתה שיחה על העברת הגופות שנמצאות בבית קברות שדה, שבו הגופות האלה הולכות ונעלמות. עוד מעט לא יהיה מה להעביר".