היועץ המשפטי לממשלה אליקים רובינשטיין, החליט שאין מקום לחקירה משטרתית ולמיצוי הדין הפלילי בטיעונים שהועלו כנגד מנהל המכס ומע"מ מוטי איילון, אלא להסתפק במיצוי הדין המשמעתי כנגדו.
ההחלטה התקבלה על-דעת פרקליטת המדינה עדנה ארבל, ולאחר שקיים רובינשטיין מס' התייעצויות עם כמה בכירים בפרקליטות, ולאחר שהובאו בפניו תגובותיו של איילון - באמצעות פרקליטו עו"ד יעקב וינרוט.
עיקר הטיעונים כנגד איילון נוגעים לחשד להדחת נהגו לעדות שקר בבית הדין הרבני (בעניין אישי הנוגע לאיילון עצמו), וכן בשימוש שלא כדין ברכבו כעובד המדינה ובביצוע עבודה פרטית (מתן הרצאות בשכר) ללא היתר הנציבות.
נודע, כי בדיונים פנימיים שהתקיימו, התגבשה הדיעה לפיה במקרה זה אין מדובר במעשים פליליים הפוגעים במישרין בציבור הרחב, אלא במעשים בלתי תקינים לכאורה שנעשו אגב נסיבות מיוחדות. אי-לכך, הוחלט, אין מקום להעברת התיק לחקירת המשטרה ולמיצוי הדין לפי הדין הפלילי.
בתגובה רשמית שמסר רובינשטיין לגלובס נמסר, כי "נוכח הממצאים לכאורה העולים מהתיק יש להעביר את התיק לחקירה במישור המשמעתי בנציבות שירות המדינה. היועץ המשפטי הבהיר לגורמים הנוגעים בדבר בנציבות, את עמדתו באשר לטיפול בתיק שהוא רואה בו חשיבות".
